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क्यूबेक, कनाडा में SARS-CoV-2 परिचय कार्यक्रम


कोरोनावायरस रोग 2019 (COVID-19) महामारी दुनिया भर में तेजी से फैल गई, जिससे पांच मिलियन से अधिक मौतें हुईं और कई देशों को कई आर्थिक संकटों को जन्म देने वाले महंगे प्रतिबंध लगाने के लिए मजबूर होना पड़ा। तेजी से संचरण, जोखिम वाले समूहों के बीच उच्च मृत्यु दर, और प्रारंभिक उपचारों की कमी के परिणामस्वरूप सामाजिक दूरी के उपाय, अनिवार्य फेस मास्क और सार्वजनिक क्षेत्र बंद हो गए।

अध्ययन: क्यूबेक, कनाडा में SARS-CoV-2 के व्यापक प्रसारण की शुरुआत की एक छोटी संख्या ने व्यापक प्रसार किया. छवि क्रेडिट: मर्वस / शटरस्टॉक

जबकि बड़े पैमाने पर टीकाकरण योजनाओं ने बीमारी को नियंत्रण में लाना शुरू कर दिया है, कई देश अभी भी टीकाकरण के रसद के साथ संघर्ष कर रहे हैं, और चिंता के खतरनाक नए रूप सामने आ रहे हैं। बीमारी के निरंतर खतरे को देखते हुए, यह समझना महत्वपूर्ण है कि नए वातावरण में प्रवेश करने पर वायरस का प्रकोप और उसका पैटर्न कैसे सामने आता है। में प्रकाशित एक अध्ययन में जीनोम मेडिसिन, मैकगिल विश्वविद्यालय के शोधकर्ता क्यूबेक में परिचय कार्यक्रमों की संख्या की जांच कर रहे हैं।

द स्टडी

शोधकर्ताओं ने 1 जून तक महामारी की शुरुआत से क्यूबेक की सार्वजनिक स्वास्थ्य प्रयोगशाला से COVID-19 के लिए सकारात्मक नासॉफिरिन्जियल स्वैब का चयन किया।अनुसूचित जनजाति, 2020। कुल मिलाकर, उन्होंने लगभग 3000 गंभीर तीव्र श्वसन सिंड्रोम कोरोनावायरस 2 (SARS-CoV-2) जीनोम का अनुक्रम किया। ई और एन जीन को लक्षित करने वाले पीसीआर परीक्षणों के माध्यम से सकारात्मक दिखाए गए किसी भी नमूने को यादृच्छिक रूप से चुना गया और अनुक्रमित किया गया। आरएनए नमूनों को 96 अच्छी तरह से प्रारूप में संसाधित किया गया था। पानी और निष्कर्षण बफर रिक्त स्थान का उपयोग नकारात्मक नियंत्रण के रूप में किया गया था, जबकि व्यावसायिक रूप से उपलब्ध आरएनए / सीडीएनए / वायरल संस्कृति का उपयोग सकारात्मक नियंत्रण के रूप में किया गया था।

शोधकर्ताओं ने जीनोम के बीच संबंधों का पता लगाने के लिए कच्चे और समय के आकार के दोनों प्रकार के फाईलोजेनोमिक पेड़ बनाए। क्यूबेक में परिचय की घटनाओं को समय के पेड़ में गैर-क्यूबेक और क्यूबेक नोड्स का अनुमान लगाने के लिए एक असतत चरित्र पैतृक राज्य पुनर्निर्माण का उपयोग करके निर्धारित किया गया था। पहचाने गए नोड्स के सेट में, वैज्ञानिकों ने सबसे बेसल की तलाश की और उन सभी नोड्स को त्याग दिया जो उनके सेट में अन्य नोड्स के वंशज थे। शेष नोड्स के माता-पिता संक्रमण के गैर-क्यूबेक नोड हैं – जहां परिचय घटना हुई थी। हालांकि इसने परिचय की संख्या को कम करके आंका, लेकिन इन घटनाओं को निर्धारित करने के अधिकांश तरीके कुछ हद तक गलत होंगे।

इसके बाद पहचाने गए उम्मीदवारों की यात्रा इतिहास डेटा के साथ क्रॉस-चेकिंग की गई। कई बेसल क्यूबेक अनुक्रमों के साथ एक पॉलीटॉमी के मामले में, सबसे छोटी शाखा की लंबाई को चुना गया था। वायरल प्रभावी जनसंख्या आकार में परिवर्तन और एक मानक तटस्थ मॉडल से विचलन का निर्धारण करने के लिए, शोधकर्ताओं ने 20 फरवरी, 2020 और 10 जून, 2020 के बीच हर दो सप्ताह में 20 आम सहमति अनुक्रमों को यादृच्छिक रूप से नमूना करके ताजिमा के डी की गणना की।

कुल मिलाकर, ये जीनोम अनुक्रम रिपोर्ट किए गए मामलों के 5.7% को कवर करते हैं। 1 अप्रैल तक, मामलों की औसत आयु लगभग 50 वर्ष थी, जिसके बाद यह बढ़कर 75 हो गई – जो देखभाल सुविधाओं में वायरस के प्रसार का संकेत देती है। क्यूबेक को देखभाल सुविधाओं में सीओवीआईडी ​​​​-19 के प्रकोप से बहुत नुकसान हुआ, जिसमें कम से कम एक मामले में 500 से अधिक रिपोर्टिंग हुई।

क्यूबेक में COVID-19 के अधिकांश परिचय यूरोप में प्रवेश करने वाले यात्रियों के थे। जबकि मार्च में एक संगरोध रखा गया था, 1500 से अधिक संक्रमित यात्री पहले ही लौट चुके थे। सभी में अद्वितीय उपभेद या उपभेद नहीं थे जो पहले से ही पेश नहीं किए गए थे और सभी यात्री से नहीं फैले थे।

कुल 615 स्वतंत्र परिचय कार्यक्रमों की खोज की गई। साक्ष्य ने एक बढ़ती हुई वायरल आबादी को दिखाया जब तक कि प्रतिबंध के उपायों को पेश नहीं किया गया, प्रत्येक स्वतंत्र वंश के प्रसार के साथ यूरोप से थोड़ा पीछे रह गया। क्यूबेक में कई परिचय स्प्रिंग ब्रेक के बाद हुए – परिवारों और विश्वविद्यालय के छात्रों दोनों के लिए एक लोकप्रिय छुट्टी का समय, विशेष रूप से और संयुक्त राज्य अमेरिका से, जो नियंत्रण उपायों को शुरू करने में अन्य देशों से पिछड़ गया और बढ़ते मामलों की संख्या के साथ संघर्ष किया।

जबकि पिछले अध्ययनों ने पहले आधिकारिक मामलों को दर्ज करने से पहले गुप्त परिचय की खोज की थी, इस अध्ययन में कोई भी नहीं देखा गया था। हालाँकि, अधिकांश गुप्त परिचय एशिया या यूरोप में खोजे गए हैं, इसलिए यह आवश्यक रूप से विरोधाभासी नहीं है। आम तौर पर सबसे सफल वंश वे थे जो जल्द से जल्द पहुंचे – उन्होंने सबसे व्यापक रूप से फैलाया और सबसे नई वंशावली को जन्म दिया। अन्य देशों ने इसी तरह के परिणाम देखे हैं, यूके में आठ परिचयों ने वंशावली को जन्म दिया है जो कि ~ 25% मामलों के लिए जिम्मेदार है।

निष्कर्ष

शोधकर्ता क्यूबेक में बीमारी के प्रसार में एक प्रमुख कारक के रूप में शुरुआती वसंत के ब्रेक को उजागर करते हैं – कनाडा के बाकी हिस्सों के विपरीत, क्यूबेक हॉलिडेमेकर्स संगरोध के प्रभावी होने से पहले लौट आए। इसके परिणामस्वरूप कनाडा के बाकी हिस्सों की तुलना में तेजी से संचरण और बहुत बड़ी पहली लहर हुई। वैज्ञानिकों ने यहां जांच की गई जानकारी सार्वजनिक स्वास्थ्य नीति निर्माताओं के लिए अमूल्य हो सकती है और भविष्य में बीमारी के प्रसार को रोकने में मदद करने के लिए भविष्य के प्रतिबंधों की योजना बनाने में मदद कर सकती है।

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